Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Mrpl39Q9JKF7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mrpl39Q9JKF7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mrpl39Q9JKF7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Mrpl39Q9JKF7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Mrpl39Q9JKF7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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