Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr61Q9ERF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms