Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clstn2Q9ER65 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms