Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx12Q9ER00 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms