Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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