Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms