Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl28Q9D1B9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms