Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Utp11Q9CZJ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp11Q9CZJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms