Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnih4Q9CX13 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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