Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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