Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TpbpbQ9CQC0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TpbpbQ9CQC0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms