Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psip1Q99JF8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psip1Q99JF8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms