Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms