Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prss28Q924N9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms