Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z25

Ofd1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ofd1Q80Z25 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ofd1Q80Z25 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ofd1Q80Z25 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms