Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFXL1Q6ZNB6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFXL1Q6ZNB6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms