Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja6Q6S5G4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms