Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Lce3fQ6PAI4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms