Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Asic1Q6NXK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms