Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REEP3Q6NUK4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REEP3Q6NUK4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms