Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retreg2Q6NS82 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retreg2Q6NS82 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms