Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg9bQ6EBV9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg9bQ6EBV9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms