Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vat1Q62465 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms