Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim38Q5SZ99 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Trim38Q5SZ99 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim38Q5SZ99 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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