Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Sft2d1Q5SSN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sft2d1Q5SSN7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms