Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U6N9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U6N9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms