Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ulk3Q3U3Q1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms