Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TraddQ3U0V2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TraddQ3U0V2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms