Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnjQ3TZI6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcnjQ3TZI6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnjQ3TZI6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms