Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc136Q3TVA9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc136Q3TVA9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms