Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Defa26Q3L180 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Defa26Q3L180 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Defa26Q3L180 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa26Q3L180 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Defa26Q3L180 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Defa26Q3L180 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Defa26Q3L180 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa26Q3L180 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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