Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
CTF3Q12748 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
CTF3Q12748 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.72□□□□□ -2.52
CTF3Q12748 snR77snR77 88 nt-0.77□□□□□ -2.53
CTF3Q12748 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.79□□□□□ -2.54
CTF3Q12748 snR53snR53 91 nt-0.8□□□□□ -2.54
CTF3Q12748 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
CTF3Q12748 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
CTF3Q12748 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.88□□□□□ -2.55
CTF3Q12748 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
CTF3Q12748 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.97□□□□□ -2.56
CTF3Q12748 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.07□□□□□ -2.58
CTF3Q12748 snR6snR6 112 nt-1.18□□□□□ -2.6
CTF3Q12748 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.19□□□□□ -2.6
CTF3Q12748 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.2□□□□□ -2.6
CTF3Q12748 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.31□□□□□ -2.62
CTF3Q12748 YOR309CYOR309C 381 nt-1.31□□□□□ -2.62
CTF3Q12748 snR73snR73 106 nt-1.33□□□□□ -2.62
CTF3Q12748 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.35□□□□□ -2.63
CTF3Q12748 snR40snR40 97 nt-1.55□□□□□ -2.66
CTF3Q12748 snR75snR75 89 nt-1.77□□□□□ -2.69
CTF3Q12748 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.82□□□□□ -2.7
CTF3Q12748 snR58snR58 96 nt-1.83□□□□□ -2.7
CTF3Q12748 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.92□□□□□ -2.72
CTF3Q12748 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.98□□□□□ -2.73
CTF3Q12748 snR87snR87 109 nt-2.01□□□□□ -2.73
CTF3Q12748 YDR543CYDR543C 300 nt-2.16□□□□□ -2.76
CTF3Q12748 YJR162CYJR162C 351 nt-3.24□□□□□ -2.93
CTF3Q12748 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.44□□□□□ -2.96
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.5 ms