Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 snR77snR77 88 nt-0.35□□□□□ -2.47
RKM4Q12504 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.39□□□□□ -2.47
RKM4Q12504 URB1YKL014C 5295 nt-0.51□□□□□ -2.49
RKM4Q12504 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.66□□□□□ -2.51
RKM4Q12504 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
RKM4Q12504 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RKM4Q12504 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RKM4Q12504 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.7□□□□□ -2.52
RKM4Q12504 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.79□□□□□ -2.54
RKM4Q12504 snR75snR75 89 nt-0.8□□□□□ -2.54
RKM4Q12504 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.88□□□□□ -2.55
RKM4Q12504 snR6snR6 112 nt-0.94□□□□□ -2.56
RKM4Q12504 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.95□□□□□ -2.56
RKM4Q12504 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.98□□□□□ -2.57
RKM4Q12504 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.99□□□□□ -2.57
RKM4Q12504 snR40snR40 97 nt-0.99□□□□□ -2.57
RKM4Q12504 YNR077CYNR077C 255 nt-1.09□□□□□ -2.58
RKM4Q12504 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.09□□□□□ -2.58
RKM4Q12504 snR73snR73 106 nt-1.17□□□□□ -2.6
RKM4Q12504 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.28□□□□□ -2.61
RKM4Q12504 YOR309CYOR309C 381 nt-1.33□□□□□ -2.62
RKM4Q12504 snR58snR58 96 nt-1.63□□□□□ -2.67
RKM4Q12504 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.71□□□□□ -2.68
RKM4Q12504 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.82□□□□□ -2.7
RKM4Q12504 snR87snR87 109 nt-2.02□□□□□ -2.73
RKM4Q12504 YDR543CYDR543C 300 nt-2.48□□□□□ -2.81
RKM4Q12504 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.67□□□□□ -2.84
RKM4Q12504 YJR162CYJR162C 351 nt-3.3□□□□□ -2.94
RKM4Q12504 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.43□□□□□ -2.96
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms