Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 snR85snR85 171 nt-2.7□□□□□ -2.84
SNF8Q12483 snR62snR62 100 nt-2.74□□□□□ -2.85
SNF8Q12483 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.77□□□□□ -2.85
SNF8Q12483 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.78□□□□□ -2.85
SNF8Q12483 YNL170WYNL170W 396 nt-2.8□□□□□ -2.86
SNF8Q12483 YLR294CYLR294C 330 nt-2.88□□□□□ -2.87
SNF8Q12483 snR64snR64 101 nt-2.91□□□□□ -2.88
SNF8Q12483 YOR225WYOR225W 330 nt-3□□□□□ -2.89
SNF8Q12483 YDR543CYDR543C 300 nt-3.07□□□□□ -2.9
SNF8Q12483 ATP8Q0080 147 nt-3.22□□□□□ -2.92
SNF8Q12483 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.23□□□□□ -2.93
SNF8Q12483 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.24□□□□□ -2.93
SNF8Q12483 YMR326CYMR326C 309 nt-3.41□□□□□ -2.96
SNF8Q12483 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-3.42□□□□□ -2.96
SNF8Q12483 Q0143Q0143 153 nt-3.43□□□□□ -2.96
SNF8Q12483 YHR217CYHR217C 462 nt-3.45□□□□□ -2.96
SNF8Q12483 snR87snR87 109 nt-3.46□□□□□ -2.96
SNF8Q12483 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.51□□□□□ -2.97
SNF8Q12483 snR53snR53 91 nt-3.51□□□□□ -2.97
SNF8Q12483 snR58snR58 96 nt-3.58□□□□□ -2.98
SNF8Q12483 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.63□□□□□ -2.99
SNF8Q12483 Q0092Q0092 141 nt-3.72□□□□□ -3
SNF8Q12483 YBL109WYBL109W 336 nt-3.81□□□□□ -3.02
SNF8Q12483 snR40snR40 97 nt-3.83□□□□□ -3.02
SNF8Q12483 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.02□□□□□ -3.05
SNF8Q12483 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-4.13□□□□□ -3.07
SNF8Q12483 YJR162CYJR162C 351 nt-4.21□□□□□ -3.08
SNF8Q12483 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.98□□□□□ -3.21
SNF8Q12483 snR75snR75 89 nt-5.07□□□□□ -3.22
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.5 ms