Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.12□□□□□ -2.43
TRM11Q12463 snR161snR161 161 nt-0.17□□□□□ -2.44
TRM11Q12463 snR75snR75 89 nt-0.22□□□□□ -2.44
TRM11Q12463 snR40snR40 97 nt-0.52□□□□□ -2.49
TRM11Q12463 URB1YKL014C 5295 nt-0.55□□□□□ -2.5
TRM11Q12463 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
TRM11Q12463 snR6snR6 112 nt-0.61□□□□□ -2.51
TRM11Q12463 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.62□□□□□ -2.51
TRM11Q12463 snR33snR33 183 nt-0.66□□□□□ -2.52
TRM11Q12463 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.68□□□□□ -2.52
TRM11Q12463 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.68□□□□□ -2.52
TRM11Q12463 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.69□□□□□ -2.52
TRM11Q12463 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
TRM11Q12463 snR73snR73 106 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM11Q12463 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM11Q12463 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM11Q12463 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
TRM11Q12463 YNR077CYNR077C 255 nt-0.93□□□□□ -2.56
TRM11Q12463 YOR309CYOR309C 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
TRM11Q12463 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.99□□□□□ -2.57
TRM11Q12463 snR58snR58 96 nt-1.19□□□□□ -2.6
TRM11Q12463 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.2□□□□□ -2.6
TRM11Q12463 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.25□□□□□ -2.61
TRM11Q12463 snR87snR87 109 nt-1.5□□□□□ -2.65
TRM11Q12463 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.12□□□□□ -2.75
TRM11Q12463 YDR543CYDR543C 300 nt-2.28□□□□□ -2.77
TRM11Q12463 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.29□□□□□ -2.78
TRM11Q12463 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.19□□□□□ -2.92
TRM11Q12463 YJR162CYJR162C 351 nt-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.8 ms