Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.89□□□□□ -2.55
NOP56Q12460 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.89□□□□□ -2.55
NOP56Q12460 snR53snR53 91 nt-0.91□□□□□ -2.56
NOP56Q12460 snR77snR77 88 nt-0.96□□□□□ -2.56
NOP56Q12460 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.97□□□□□ -2.56
NOP56Q12460 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.07□□□□□ -2.58
NOP56Q12460 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.1□□□□□ -2.59
NOP56Q12460 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.11□□□□□ -2.59
NOP56Q12460 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.26□□□□□ -2.61
NOP56Q12460 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.28□□□□□ -2.61
NOP56Q12460 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.29□□□□□ -2.62
NOP56Q12460 YNR077CYNR077C 255 nt-1.41□□□□□ -2.64
NOP56Q12460 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.49□□□□□ -2.65
NOP56Q12460 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.49□□□□□ -2.65
NOP56Q12460 snR6snR6 112 nt-1.5□□□□□ -2.65
NOP56Q12460 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.54□□□□□ -2.66
NOP56Q12460 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.61□□□□□ -2.67
NOP56Q12460 YOR309CYOR309C 381 nt-1.7□□□□□ -2.68
NOP56Q12460 snR73snR73 106 nt-1.71□□□□□ -2.68
NOP56Q12460 snR40snR40 97 nt-1.95□□□□□ -2.72
NOP56Q12460 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.1□□□□□ -2.75
NOP56Q12460 snR75snR75 89 nt-2.18□□□□□ -2.76
NOP56Q12460 snR58snR58 96 nt-2.27□□□□□ -2.77
NOP56Q12460 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.47□□□□□ -2.8
NOP56Q12460 snR87snR87 109 nt-2.59□□□□□ -2.82
NOP56Q12460 YDR543CYDR543C 300 nt-2.95□□□□□ -2.88
NOP56Q12460 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.16□□□□□ -2.92
NOP56Q12460 YJR162CYJR162C 351 nt-3.87□□□□□ -3.03
NOP56Q12460 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.12□□□□□ -3.07
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms