Protein–RNA interactions for Protein: Q12429

DPH6, Diphthine--ammonia ligase, yeastyeast

Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPH6Q12429 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.56□□□□□ -2.32
DPH6Q12429 snR6snR6 112 nt0.55□□□□□ -2.32
DPH6Q12429 snR128snR128 126 nt0.53□□□□□ -2.32
DPH6Q12429 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.49□□□□□ -2.33
DPH6Q12429 snR161snR161 161 nt0.47□□□□□ -2.33
DPH6Q12429 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.43□□□□□ -2.34
DPH6Q12429 snR73snR73 106 nt0.38□□□□□ -2.35
DPH6Q12429 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
DPH6Q12429 YJL113WYJL113W 4647 nt0.33□□□□□ -2.36
DPH6Q12429 snR58snR58 96 nt0.29□□□□□ -2.36
DPH6Q12429 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.13□□□□□ -2.39
DPH6Q12429 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.08□□□□□ -2.4
DPH6Q12429 URB1YKL014C 5295 nt0.05□□□□□ -2.4
DPH6Q12429 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.12□□□□□ -2.43
DPH6Q12429 snR87snR87 109 nt-0.13□□□□□ -2.43
DPH6Q12429 YOR309CYOR309C 381 nt-0.13□□□□□ -2.43
DPH6Q12429 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.25□□□□□ -2.45
DPH6Q12429 YNR077CYNR077C 255 nt-0.34□□□□□ -2.46
DPH6Q12429 snR33snR33 183 nt-0.41□□□□□ -2.48
DPH6Q12429 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
DPH6Q12429 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
DPH6Q12429 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
DPH6Q12429 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.76□□□□□ -2.53
DPH6Q12429 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.79□□□□□ -2.54
DPH6Q12429 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.42□□□□□ -2.64
DPH6Q12429 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.49□□□□□ -2.65
DPH6Q12429 YDR543CYDR543C 300 nt-1.68□□□□□ -2.68
DPH6Q12429 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.76□□□□□ -2.69
DPH6Q12429 YJR162CYJR162C 351 nt-2.68□□□□□ -2.84
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4 ms