Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.06□□□□□ -2.4
NPC2Q12408 snR161snR161 161 nt-0.09□□□□□ -2.42
NPC2Q12408 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.23□□□□□ -2.45
NPC2Q12408 snR40snR40 97 nt-0.27□□□□□ -2.45
NPC2Q12408 snR6snR6 112 nt-0.47□□□□□ -2.48
NPC2Q12408 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.48□□□□□ -2.49
NPC2Q12408 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.51□□□□□ -2.49
NPC2Q12408 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.51□□□□□ -2.49
NPC2Q12408 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.51□□□□□ -2.49
NPC2Q12408 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
NPC2Q12408 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.59□□□□□ -2.5
NPC2Q12408 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
NPC2Q12408 snR73snR73 106 nt-0.67□□□□□ -2.52
NPC2Q12408 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
NPC2Q12408 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
NPC2Q12408 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.69□□□□□ -2.52
NPC2Q12408 URB1YKL014C 5295 nt-0.71□□□□□ -2.52
NPC2Q12408 YOR309CYOR309C 381 nt-0.84□□□□□ -2.54
NPC2Q12408 snR58snR58 96 nt-0.94□□□□□ -2.56
NPC2Q12408 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.96□□□□□ -2.56
NPC2Q12408 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.08□□□□□ -2.58
NPC2Q12408 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.11□□□□□ -2.59
NPC2Q12408 snR87snR87 109 nt-1.3□□□□□ -2.62
NPC2Q12408 YNR077CYNR077C 255 nt-1.34□□□□□ -2.62
NPC2Q12408 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.85□□□□□ -2.71
NPC2Q12408 YDR543CYDR543C 300 nt-2.51□□□□□ -2.81
NPC2Q12408 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.74□□□□□ -2.85
NPC2Q12408 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.85□□□□□ -2.87
NPC2Q12408 YJR162CYJR162C 351 nt-3.38□□□□□ -2.95
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.2 ms