Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1A-NL1Q12391 snR161snR161 161 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1A-NL1Q12391 YOL014WYOL014W 375 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1A-NL1Q12391 YJL113WYJL113W 4647 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1A-NL1Q12391 RPL41BYDL133C-A 78 nt0□□□□□ -2.41
TY1A-NL1Q12391 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1A-NL1Q12391 snR6snR6 112 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1A-NL1Q12391 snR73snR73 106 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1A-NL1Q12391 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1A-NL1Q12391 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1A-NL1Q12391 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1A-NL1Q12391 snR58snR58 96 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1A-NL1Q12391 URB1YKL014C 5295 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1A-NL1Q12391 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1A-NL1Q12391 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1A-NL1Q12391 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1A-NL1Q12391 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1A-NL1Q12391 snR33snR33 183 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1A-NL1Q12391 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1A-NL1Q12391 YOR309CYOR309C 381 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1A-NL1Q12391 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1A-NL1Q12391 snR87snR87 109 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1A-NL1Q12391 YNR077CYNR077C 255 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1A-NL1Q12391 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.02□□□□□ -2.57
TY1A-NL1Q12391 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.3□□□□□ -2.62
TY1A-NL1Q12391 YDR543CYDR543C 300 nt-1.68□□□□□ -2.68
TY1A-NL1Q12391 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.96□□□□□ -2.72
TY1A-NL1Q12391 YJR162CYJR162C 351 nt-2.27□□□□□ -2.77
TY1A-NL1Q12391 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.52□□□□□ -2.81
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 2.8 ms