Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 snR33snR33 183 nt-0.58□□□□□ -2.5
HRT3Q12347 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.59□□□□□ -2.5
HRT3Q12347 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.66□□□□□ -2.52
HRT3Q12347 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
HRT3Q12347 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.69□□□□□ -2.52
HRT3Q12347 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
HRT3Q12347 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
HRT3Q12347 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
HRT3Q12347 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.76□□□□□ -2.53
HRT3Q12347 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.76□□□□□ -2.53
HRT3Q12347 snR6snR6 112 nt-0.9□□□□□ -2.55
HRT3Q12347 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.9□□□□□ -2.55
HRT3Q12347 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.91□□□□□ -2.56
HRT3Q12347 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.92□□□□□ -2.56
HRT3Q12347 YNR077CYNR077C 255 nt-0.99□□□□□ -2.57
HRT3Q12347 snR73snR73 106 nt-1.04□□□□□ -2.58
HRT3Q12347 YOR309CYOR309C 381 nt-1.05□□□□□ -2.58
HRT3Q12347 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.11□□□□□ -2.59
HRT3Q12347 snR40snR40 97 nt-1.12□□□□□ -2.59
HRT3Q12347 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.16□□□□□ -2.6
HRT3Q12347 snR75snR75 89 nt-1.22□□□□□ -2.6
HRT3Q12347 snR58snR58 96 nt-1.45□□□□□ -2.64
HRT3Q12347 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.56□□□□□ -2.66
HRT3Q12347 snR87snR87 109 nt-1.62□□□□□ -2.67
HRT3Q12347 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.82□□□□□ -2.7
HRT3Q12347 YDR543CYDR543C 300 nt-2.62□□□□□ -2.83
HRT3Q12347 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.75□□□□□ -2.85
HRT3Q12347 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.87□□□□□ -2.87
HRT3Q12347 YJR162CYJR162C 351 nt-3.52□□□□□ -2.97
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.6 ms