Protein–RNA interactions for Protein: Q12340

YRM1, Zinc finger transcription factor YRM1, yeastyeast

Predictions only

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRM1Q12340 snR161snR161 161 nt-0.25□□□□□ -2.45
YRM1Q12340 URB1YKL014C 5295 nt-0.26□□□□□ -2.45
YRM1Q12340 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.31□□□□□ -2.46
YRM1Q12340 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
YRM1Q12340 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.36□□□□□ -2.47
YRM1Q12340 snR6snR6 112 nt-0.37□□□□□ -2.47
YRM1Q12340 snR33snR33 183 nt-0.39□□□□□ -2.47
YRM1Q12340 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.42□□□□□ -2.48
YRM1Q12340 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRM1Q12340 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRM1Q12340 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.44□□□□□ -2.48
YRM1Q12340 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.47□□□□□ -2.48
YRM1Q12340 snR73snR73 106 nt-0.51□□□□□ -2.49
YRM1Q12340 YNR077CYNR077C 255 nt-0.53□□□□□ -2.49
YRM1Q12340 YOR309CYOR309C 381 nt-0.53□□□□□ -2.49
YRM1Q12340 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.55□□□□□ -2.5
YRM1Q12340 snR40snR40 97 nt-0.64□□□□□ -2.51
YRM1Q12340 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRM1Q12340 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRM1Q12340 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.74□□□□□ -2.53
YRM1Q12340 snR75snR75 89 nt-0.76□□□□□ -2.53
YRM1Q12340 snR87snR87 109 nt-0.9□□□□□ -2.55
YRM1Q12340 snR58snR58 96 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRM1Q12340 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRM1Q12340 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRM1Q12340 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.53□□□□□ -2.65
YRM1Q12340 YDR543CYDR543C 300 nt-1.67□□□□□ -2.68
YRM1Q12340 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.88□□□□□ -2.71
YRM1Q12340 YJR162CYJR162C 351 nt-2.37□□□□□ -2.79
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.7 ms