Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.54□□□□□ -2.32
TFC8Q12308 URB1YKL014C 5295 nt0.36□□□□□ -2.35
TFC8Q12308 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.34□□□□□ -2.36
TFC8Q12308 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.3□□□□□ -2.36
TFC8Q12308 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.15□□□□□ -2.39
TFC8Q12308 snR87snR87 109 nt0.08□□□□□ -2.4
TFC8Q12308 YNR077CYNR077C 255 nt0.03□□□□□ -2.4
TFC8Q12308 YOR309CYOR309C 381 nt-0.09□□□□□ -2.42
TFC8Q12308 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.38□□□□□ -2.47
TFC8Q12308 snR33snR33 183 nt-0.51□□□□□ -2.49
TFC8Q12308 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TFC8Q12308 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TFC8Q12308 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TFC8Q12308 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.67□□□□□ -2.52
TFC8Q12308 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-0.85□□□□□ -2.55
TFC8Q12308 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.99□□□□□ -2.57
TFC8Q12308 YDR543CYDR543C 300 nt-1.53□□□□□ -2.65
TFC8Q12308 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.82□□□□□ -2.7
TFC8Q12308 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.17□□□□□ -2.76
TFC8Q12308 YJR162CYJR162C 351 nt-2.76□□□□□ -2.85
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.5 ms