Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.28□□□□□ -2.36
TY1A-BLQ12266 snR58snR58 96 nt0.27□□□□□ -2.37
TY1A-BLQ12266 snR73snR73 106 nt0.26□□□□□ -2.37
TY1A-BLQ12266 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1A-BLQ12266 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1A-BLQ12266 URB1YKL014C 5295 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1A-BLQ12266 YOR309CYOR309C 381 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1A-BLQ12266 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1A-BLQ12266 snR87snR87 109 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1A-BLQ12266 snR33snR33 183 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1A-BLQ12266 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1A-BLQ12266 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1A-BLQ12266 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1A-BLQ12266 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.74□□□□□ -2.53
TY1A-BLQ12266 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1A-BLQ12266 YNR077CYNR077C 255 nt-0.92□□□□□ -2.56
TY1A-BLQ12266 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.4□□□□□ -2.63
TY1A-BLQ12266 YDR543CYDR543C 300 nt-1.67□□□□□ -2.68
TY1A-BLQ12266 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.89□□□□□ -2.71
TY1A-BLQ12266 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.97□□□□□ -2.72
TY1A-BLQ12266 YJR162CYJR162C 351 nt-2.37□□□□□ -2.79
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