Protein–RNA interactions for Protein: Q12232

SLP1, Uncharacterized protein SLP1, yeastyeast

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLP1Q12232 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.33□□□□□ -2.36
SLP1Q12232 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.23□□□□□ -2.37
SLP1Q12232 snR161snR161 161 nt0.15□□□□□ -2.39
SLP1Q12232 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.02□□□□□ -2.41
SLP1Q12232 snR6snR6 112 nt-0.04□□□□□ -2.42
SLP1Q12232 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.06□□□□□ -2.42
SLP1Q12232 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.13□□□□□ -2.43
SLP1Q12232 snR73snR73 106 nt-0.24□□□□□ -2.45
SLP1Q12232 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.24□□□□□ -2.45
SLP1Q12232 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.34□□□□□ -2.46
SLP1Q12232 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.39□□□□□ -2.47
SLP1Q12232 URB1YKL014C 5295 nt-0.46□□□□□ -2.48
SLP1Q12232 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.5□□□□□ -2.49
SLP1Q12232 snR58snR58 96 nt-0.52□□□□□ -2.49
SLP1Q12232 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.54□□□□□ -2.5
SLP1Q12232 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
SLP1Q12232 YOR309CYOR309C 381 nt-0.6□□□□□ -2.51
SLP1Q12232 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
SLP1Q12232 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
SLP1Q12232 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
SLP1Q12232 snR87snR87 109 nt-0.9□□□□□ -2.55
SLP1Q12232 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.09□□□□□ -2.58
SLP1Q12232 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.09□□□□□ -2.58
SLP1Q12232 YNR077CYNR077C 255 nt-1.25□□□□□ -2.61
SLP1Q12232 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.84□□□□□ -2.7
SLP1Q12232 YDR543CYDR543C 300 nt-2.48□□□□□ -2.81
SLP1Q12232 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.68□□□□□ -2.84
SLP1Q12232 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.84□□□□□ -2.86
SLP1Q12232 YJR162CYJR162C 351 nt-3.44□□□□□ -2.96
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms