Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.79□□□□□ -2.28
NCR1Q12200 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
NCR1Q12200 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
NCR1Q12200 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
NCR1Q12200 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
NCR1Q12200 snR128snR128 126 nt0.72□□□□□ -2.29
NCR1Q12200 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.71□□□□□ -2.3
NCR1Q12200 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
NCR1Q12200 snR87snR87 109 nt0.7□□□□□ -2.3
NCR1Q12200 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
NCR1Q12200 URB1YKL014C 5295 nt0.62□□□□□ -2.31
NCR1Q12200 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.53□□□□□ -2.32
NCR1Q12200 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.52□□□□□ -2.33
NCR1Q12200 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.46□□□□□ -2.34
NCR1Q12200 YOR309CYOR309C 381 nt0.38□□□□□ -2.35
NCR1Q12200 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.24□□□□□ -2.37
NCR1Q12200 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt0.04□□□□□ -2.4
NCR1Q12200 snR33snR33 183 nt-0.21□□□□□ -2.44
NCR1Q12200 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.41□□□□□ -2.48
NCR1Q12200 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NCR1Q12200 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NCR1Q12200 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
NCR1Q12200 YNR077CYNR077C 255 nt-0.7□□□□□ -2.52
NCR1Q12200 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-0.72□□□□□ -2.52
NCR1Q12200 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.87□□□□□ -2.55
NCR1Q12200 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.13□□□□□ -2.59
NCR1Q12200 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.84□□□□□ -2.7
NCR1Q12200 YDR543CYDR543C 300 nt-1.94□□□□□ -2.72
NCR1Q12200 YJR162CYJR162C 351 nt-2.48□□□□□ -2.81
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms