Protein–RNA interactions for Protein: Q12199

TIP41, Type 2A phosphatase activator TIP41, yeastyeast

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP41Q12199 snR77snR77 88 nt-0.24□□□□□ -2.45
TIP41Q12199 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.26□□□□□ -2.45
TIP41Q12199 snR161snR161 161 nt-0.26□□□□□ -2.45
TIP41Q12199 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
TIP41Q12199 snR33snR33 183 nt-0.42□□□□□ -2.48
TIP41Q12199 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.47□□□□□ -2.48
TIP41Q12199 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.47□□□□□ -2.48
TIP41Q12199 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.47□□□□□ -2.48
TIP41Q12199 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
TIP41Q12199 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
TIP41Q12199 snR6snR6 112 nt-0.56□□□□□ -2.5
TIP41Q12199 snR75snR75 89 nt-0.58□□□□□ -2.5
TIP41Q12199 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.64□□□□□ -2.51
TIP41Q12199 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.67□□□□□ -2.52
TIP41Q12199 snR40snR40 97 nt-0.69□□□□□ -2.52
TIP41Q12199 snR73snR73 106 nt-0.75□□□□□ -2.53
TIP41Q12199 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.75□□□□□ -2.53
TIP41Q12199 YOR309CYOR309C 381 nt-0.77□□□□□ -2.53
TIP41Q12199 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.78□□□□□ -2.53
TIP41Q12199 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
TIP41Q12199 YNR077CYNR077C 255 nt-0.91□□□□□ -2.56
TIP41Q12199 snR58snR58 96 nt-1.11□□□□□ -2.59
TIP41Q12199 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.16□□□□□ -2.6
TIP41Q12199 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.21□□□□□ -2.6
TIP41Q12199 snR87snR87 109 nt-1.27□□□□□ -2.61
TIP41Q12199 YDR543CYDR543C 300 nt-1.77□□□□□ -2.69
TIP41Q12199 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.11□□□□□ -2.75
TIP41Q12199 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.16□□□□□ -2.76
TIP41Q12199 YJR162CYJR162C 351 nt-2.32□□□□□ -2.78
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 4 ms