Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.44□□□□□ -2.64
RIO1Q12196 snR62snR62 100 nt-1.49□□□□□ -2.65
RIO1Q12196 snR73snR73 106 nt-1.5□□□□□ -2.65
RIO1Q12196 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.54□□□□□ -2.66
RIO1Q12196 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.56□□□□□ -2.66
RIO1Q12196 snR85snR85 171 nt-1.59□□□□□ -2.66
RIO1Q12196 ATP8Q0080 147 nt-1.59□□□□□ -2.66
RIO1Q12196 snR64snR64 101 nt-1.6□□□□□ -2.67
RIO1Q12196 Q0143Q0143 153 nt-1.75□□□□□ -2.69
RIO1Q12196 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.76□□□□□ -2.69
RIO1Q12196 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.82□□□□□ -2.7
RIO1Q12196 YMR326CYMR326C 309 nt-1.83□□□□□ -2.7
RIO1Q12196 YHR217CYHR217C 462 nt-1.85□□□□□ -2.71
RIO1Q12196 Q0092Q0092 141 nt-1.87□□□□□ -2.71
RIO1Q12196 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.88□□□□□ -2.71
RIO1Q12196 YBL109WYBL109W 336 nt-1.95□□□□□ -2.72
RIO1Q12196 snR53snR53 91 nt-1.98□□□□□ -2.73
RIO1Q12196 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2□□□□□ -2.73
RIO1Q12196 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.01□□□□□ -2.73
RIO1Q12196 snR87snR87 109 nt-2.05□□□□□ -2.74
RIO1Q12196 snR40snR40 97 nt-2.19□□□□□ -2.76
RIO1Q12196 snR58snR58 96 nt-2.2□□□□□ -2.76
RIO1Q12196 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.3□□□□□ -2.78
RIO1Q12196 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.45□□□□□ -2.8
RIO1Q12196 YDR543CYDR543C 300 nt-2.55□□□□□ -2.82
RIO1Q12196 snR75snR75 89 nt-2.92□□□□□ -2.88
RIO1Q12196 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.93□□□□□ -2.88
RIO1Q12196 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.06□□□□□ -2.9
RIO1Q12196 YJR162CYJR162C 351 nt-3.3□□□□□ -2.94
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.3 ms