Protein–RNA interactions for Protein: Q12168

ACF2, Endo-1,3(4)-beta-glucanase 2, yeastyeast

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ACF2Q12168 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.11□□□□□ -2.39
ACF2Q12168 snR40snR40 97 nt0.04□□□□□ -2.4
ACF2Q12168 snR161snR161 161 nt-0.01□□□□□ -2.41
ACF2Q12168 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.14□□□□□ -2.43
ACF2Q12168 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.22□□□□□ -2.44
ACF2Q12168 snR6snR6 112 nt-0.23□□□□□ -2.45
ACF2Q12168 URB1YKL014C 5295 nt-0.27□□□□□ -2.45
ACF2Q12168 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.31□□□□□ -2.46
ACF2Q12168 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.35□□□□□ -2.47
ACF2Q12168 snR73snR73 106 nt-0.39□□□□□ -2.47
ACF2Q12168 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.42□□□□□ -2.48
ACF2Q12168 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.49□□□□□ -2.49
ACF2Q12168 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ACF2Q12168 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ACF2Q12168 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
ACF2Q12168 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.53□□□□□ -2.49
ACF2Q12168 snR33snR33 183 nt-0.54□□□□□ -2.5
ACF2Q12168 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.65□□□□□ -2.51
ACF2Q12168 YOR309CYOR309C 381 nt-0.65□□□□□ -2.51
ACF2Q12168 YNR077CYNR077C 255 nt-0.66□□□□□ -2.52
ACF2Q12168 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.67□□□□□ -2.52
ACF2Q12168 snR58snR58 96 nt-0.73□□□□□ -2.53
ACF2Q12168 snR87snR87 109 nt-0.98□□□□□ -2.57
ACF2Q12168 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.01□□□□□ -2.57
ACF2Q12168 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.32□□□□□ -2.62
ACF2Q12168 YDR543CYDR543C 300 nt-1.53□□□□□ -2.65
ACF2Q12168 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.72□□□□□ -2.68
ACF2Q12168 YJR162CYJR162C 351 nt-2.24□□□□□ -2.77
ACF2Q12168 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.53□□□□□ -2.81
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.8 ms