Protein–RNA interactions for Protein: Q12107

APC9, Anaphase-promoting complex subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APC9Q12107 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.39□□□□□ -2.79
APC9Q12107 snR62snR62 100 nt-2.41□□□□□ -2.8
APC9Q12107 YOR225WYOR225W 330 nt-2.41□□□□□ -2.8
APC9Q12107 YNL170WYNL170W 396 nt-2.42□□□□□ -2.8
APC9Q12107 snR85snR85 171 nt-2.51□□□□□ -2.81
APC9Q12107 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-2.58□□□□□ -2.82
APC9Q12107 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-2.58□□□□□ -2.82
APC9Q12107 snR64snR64 101 nt-2.63□□□□□ -2.83
APC9Q12107 ATP8Q0080 147 nt-2.68□□□□□ -2.84
APC9Q12107 YDR543CYDR543C 300 nt-2.78□□□□□ -2.85
APC9Q12107 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.81□□□□□ -2.86
APC9Q12107 YMR326CYMR326C 309 nt-2.91□□□□□ -2.88
APC9Q12107 Q0143Q0143 153 nt-2.93□□□□□ -2.88
APC9Q12107 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.97□□□□□ -2.88
APC9Q12107 snR87snR87 109 nt-2.99□□□□□ -2.89
APC9Q12107 YHR217CYHR217C 462 nt-3□□□□□ -2.89
APC9Q12107 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.04□□□□□ -2.9
APC9Q12107 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-3.07□□□□□ -2.9
APC9Q12107 Q0092Q0092 141 nt-3.13□□□□□ -2.91
APC9Q12107 snR53snR53 91 nt-3.16□□□□□ -2.92
APC9Q12107 snR58snR58 96 nt-3.3□□□□□ -2.94
APC9Q12107 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.33□□□□□ -2.94
APC9Q12107 YBL109WYBL109W 336 nt-3.41□□□□□ -2.96
APC9Q12107 snR40snR40 97 nt-3.57□□□□□ -2.98
APC9Q12107 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-3.64□□□□□ -2.99
APC9Q12107 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-3.66□□□□□ -3
APC9Q12107 YJR162CYJR162C 351 nt-3.85□□□□□ -3.03
APC9Q12107 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.23□□□□□ -3.09
APC9Q12107 snR75snR75 89 nt-4.71□□□□□ -3.16
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms