Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YHR217CYHR217C 462 nt-0.72□□□□□ -2.52
VPS54Q12071 snR64snR64 101 nt-0.75□□□□□ -2.53
VPS54Q12071 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.75□□□□□ -2.53
VPS54Q12071 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.76□□□□□ -2.53
VPS54Q12071 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.78□□□□□ -2.53
VPS54Q12071 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.81□□□□□ -2.54
VPS54Q12071 snR6snR6 112 nt-0.87□□□□□ -2.55
VPS54Q12071 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.87□□□□□ -2.55
VPS54Q12071 YOR309CYOR309C 381 nt-0.87□□□□□ -2.55
VPS54Q12071 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.88□□□□□ -2.55
VPS54Q12071 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.89□□□□□ -2.55
VPS54Q12071 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
VPS54Q12071 snR73snR73 106 nt-0.97□□□□□ -2.56
VPS54Q12071 snR53snR53 91 nt-0.99□□□□□ -2.57
VPS54Q12071 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1□□□□□ -2.57
VPS54Q12071 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1□□□□□ -2.57
VPS54Q12071 YNR077CYNR077C 255 nt-1.01□□□□□ -2.57
VPS54Q12071 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.07□□□□□ -2.58
VPS54Q12071 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.17□□□□□ -2.6
VPS54Q12071 snR40snR40 97 nt-1.3□□□□□ -2.62
VPS54Q12071 snR87snR87 109 nt-1.41□□□□□ -2.64
VPS54Q12071 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.42□□□□□ -2.64
VPS54Q12071 snR58snR58 96 nt-1.49□□□□□ -2.65
VPS54Q12071 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.61□□□□□ -2.67
VPS54Q12071 snR75snR75 89 nt-1.66□□□□□ -2.68
VPS54Q12071 YDR543CYDR543C 300 nt-2.13□□□□□ -2.75
VPS54Q12071 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.28□□□□□ -2.77
VPS54Q12071 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.31□□□□□ -2.78
VPS54Q12071 YJR162CYJR162C 351 nt-2.71□□□□□ -2.84
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